Protein–RNA interactions for Protein: P33947

KDELR2, ER lumen protein-retaining receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR2P33947 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDELR2P33947 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDELR2P33947 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
KDELR2P33947 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KDELR2P33947 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDELR2P33947 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDELR2P33947 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDELR2P33947 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDELR2P33947 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDELR2P33947 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KDELR2P33947 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDELR2P33947 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDELR2P33947 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDELR2P33947 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KDELR2P33947 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDELR2P33947 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDELR2P33947 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDELR2P33947 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDELR2P33947 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDELR2P33947 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDELR2P33947 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDELR2P33947 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDELR2P33947 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDELR2P33947 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDELR2P33947 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDELR2P33947 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDELR2P33947 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KDELR2P33947 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDELR2P33947 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDELR2P33947 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KDELR2P33947 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDELR2P33947 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDELR2P33947 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDELR2P33947 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDELR2P33947 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDELR2P33947 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDELR2P33947 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDELR2P33947 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDELR2P33947 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDELR2P33947 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDELR2P33947 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDELR2P33947 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDELR2P33947 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDELR2P33947 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDELR2P33947 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDELR2P33947 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDELR2P33947 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDELR2P33947 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDELR2P33947 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDELR2P33947 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDELR2P33947 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDELR2P33947 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDELR2P33947 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDELR2P33947 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDELR2P33947 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDELR2P33947 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDELR2P33947 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDELR2P33947 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDELR2P33947 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDELR2P33947 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDELR2P33947 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDELR2P33947 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDELR2P33947 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDELR2P33947 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDELR2P33947 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KDELR2P33947 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KDELR2P33947 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KDELR2P33947 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KDELR2P33947 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KDELR2P33947 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KDELR2P33947 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KDELR2P33947 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KDELR2P33947 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KDELR2P33947 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDELR2P33947 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDELR2P33947 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDELR2P33947 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDELR2P33947 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KDELR2P33947 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KDELR2P33947 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KDELR2P33947 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KDELR2P33947 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KDELR2P33947 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KDELR2P33947 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KDELR2P33947 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDELR2P33947 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDELR2P33947 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDELR2P33947 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDELR2P33947 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KDELR2P33947 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDELR2P33947 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDELR2P33947 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDELR2P33947 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDELR2P33947 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDELR2P33947 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDELR2P33947 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDELR2P33947 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDELR2P33947 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDELR2P33947 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDELR2P33947 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms