Protein–RNA interactions for Protein: P29323

EPHB2, Ephrin type-B receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB2P29323 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EPHB2P29323 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EPHB2P29323 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EPHB2P29323 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EPHB2P29323 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EPHB2P29323 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EPHB2P29323 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EPHB2P29323 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EPHB2P29323 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EPHB2P29323 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EPHB2P29323 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EPHB2P29323 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
EPHB2P29323 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EPHB2P29323 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EPHB2P29323 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EPHB2P29323 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EPHB2P29323 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EPHB2P29323 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EPHB2P29323 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EPHB2P29323 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EPHB2P29323 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EPHB2P29323 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EPHB2P29323 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EPHB2P29323 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EPHB2P29323 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EPHB2P29323 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EPHB2P29323 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EPHB2P29323 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EPHB2P29323 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EPHB2P29323 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EPHB2P29323 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
EPHB2P29323 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EPHB2P29323 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EPHB2P29323 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EPHB2P29323 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EPHB2P29323 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EPHB2P29323 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EPHB2P29323 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EPHB2P29323 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EPHB2P29323 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EPHB2P29323 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EPHB2P29323 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EPHB2P29323 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EPHB2P29323 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EPHB2P29323 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EPHB2P29323 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EPHB2P29323 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EPHB2P29323 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EPHB2P29323 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EPHB2P29323 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EPHB2P29323 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EPHB2P29323 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EPHB2P29323 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EPHB2P29323 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
EPHB2P29323 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EPHB2P29323 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EPHB2P29323 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EPHB2P29323 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EPHB2P29323 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EPHB2P29323 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EPHB2P29323 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EPHB2P29323 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EPHB2P29323 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EPHB2P29323 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
EPHB2P29323 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EPHB2P29323 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EPHB2P29323 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
EPHB2P29323 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EPHB2P29323 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EPHB2P29323 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
EPHB2P29323 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EPHB2P29323 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EPHB2P29323 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EPHB2P29323 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EPHB2P29323 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EPHB2P29323 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
EPHB2P29323 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EPHB2P29323 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EPHB2P29323 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EPHB2P29323 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EPHB2P29323 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EPHB2P29323 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EPHB2P29323 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EPHB2P29323 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EPHB2P29323 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EPHB2P29323 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EPHB2P29323 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EPHB2P29323 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
EPHB2P29323 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EPHB2P29323 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EPHB2P29323 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EPHB2P29323 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EPHB2P29323 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EPHB2P29323 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EPHB2P29323 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EPHB2P29323 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EPHB2P29323 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EPHB2P29323 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EPHB2P29323 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EPHB2P29323 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9538.8 ms