Protein–RNA interactions for Protein: P28566

HTR1E, 5-hydroxytryptamine receptor 1E, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1EP28566 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HTR1EP28566 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HTR1EP28566 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HTR1EP28566 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HTR1EP28566 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HTR1EP28566 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HTR1EP28566 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTR1EP28566 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTR1EP28566 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTR1EP28566 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTR1EP28566 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTR1EP28566 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTR1EP28566 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTR1EP28566 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HTR1EP28566 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTR1EP28566 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTR1EP28566 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTR1EP28566 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTR1EP28566 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTR1EP28566 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTR1EP28566 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTR1EP28566 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTR1EP28566 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTR1EP28566 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTR1EP28566 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTR1EP28566 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTR1EP28566 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTR1EP28566 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTR1EP28566 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HTR1EP28566 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HTR1EP28566 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HTR1EP28566 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTR1EP28566 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTR1EP28566 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTR1EP28566 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTR1EP28566 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HTR1EP28566 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTR1EP28566 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTR1EP28566 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTR1EP28566 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTR1EP28566 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTR1EP28566 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTR1EP28566 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTR1EP28566 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTR1EP28566 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTR1EP28566 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTR1EP28566 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTR1EP28566 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTR1EP28566 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTR1EP28566 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTR1EP28566 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HTR1EP28566 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTR1EP28566 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTR1EP28566 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTR1EP28566 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTR1EP28566 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTR1EP28566 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTR1EP28566 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTR1EP28566 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTR1EP28566 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTR1EP28566 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HTR1EP28566 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HTR1EP28566 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTR1EP28566 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTR1EP28566 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTR1EP28566 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTR1EP28566 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTR1EP28566 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTR1EP28566 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTR1EP28566 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTR1EP28566 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTR1EP28566 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTR1EP28566 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTR1EP28566 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTR1EP28566 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTR1EP28566 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTR1EP28566 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTR1EP28566 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTR1EP28566 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTR1EP28566 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTR1EP28566 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTR1EP28566 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTR1EP28566 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTR1EP28566 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HTR1EP28566 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HTR1EP28566 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HTR1EP28566 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTR1EP28566 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTR1EP28566 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTR1EP28566 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTR1EP28566 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTR1EP28566 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTR1EP28566 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTR1EP28566 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTR1EP28566 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HTR1EP28566 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTR1EP28566 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTR1EP28566 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTR1EP28566 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HTR1EP28566 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms