Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
POLD1P28340 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
POLD1P28340 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
POLD1P28340 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
POLD1P28340 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
POLD1P28340 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
POLD1P28340 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
POLD1P28340 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
POLD1P28340 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
POLD1P28340 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
POLD1P28340 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
POLD1P28340 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
POLD1P28340 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
POLD1P28340 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
POLD1P28340 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
POLD1P28340 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
POLD1P28340 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
POLD1P28340 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC32.8■■■□□ 2.84
POLD1P28340 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
POLD1P28340 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
POLD1P28340 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
POLD1P28340 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
POLD1P28340 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
POLD1P28340 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
POLD1P28340 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
POLD1P28340 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
POLD1P28340 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
POLD1P28340 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
POLD1P28340 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
POLD1P28340 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
POLD1P28340 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
POLD1P28340 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
POLD1P28340 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
POLD1P28340 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
POLD1P28340 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
POLD1P28340 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
POLD1P28340 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
POLD1P28340 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
POLD1P28340 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
POLD1P28340 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
POLD1P28340 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
POLD1P28340 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
POLD1P28340 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
POLD1P28340 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
POLD1P28340 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
POLD1P28340 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
POLD1P28340 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
POLD1P28340 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
POLD1P28340 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
POLD1P28340 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
POLD1P28340 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
POLD1P28340 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
POLD1P28340 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
POLD1P28340 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
POLD1P28340 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
POLD1P28340 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
POLD1P28340 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
POLD1P28340 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
POLD1P28340 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
POLD1P28340 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
POLD1P28340 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
POLD1P28340 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
POLD1P28340 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
POLD1P28340 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
POLD1P28340 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
POLD1P28340 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
POLD1P28340 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
POLD1P28340 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
POLD1P28340 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
POLD1P28340 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
POLD1P28340 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
POLD1P28340 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
POLD1P28340 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
POLD1P28340 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
POLD1P28340 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
POLD1P28340 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
POLD1P28340 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
POLD1P28340 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
POLD1P28340 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
POLD1P28340 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
POLD1P28340 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
POLD1P28340 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
POLD1P28340 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
POLD1P28340 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
POLD1P28340 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
POLD1P28340 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC32.54■■■□□ 2.8
POLD1P28340 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
POLD1P28340 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
POLD1P28340 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
POLD1P28340 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
POLD1P28340 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
POLD1P28340 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
POLD1P28340 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
POLD1P28340 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
POLD1P28340 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
POLD1P28340 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
POLD1P28340 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
POLD1P28340 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
POLD1P28340 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
POLD1P28340 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms