Protein–RNA interactions for Protein: P26441

CNTF, Ciliary neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFP26441 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNTFP26441 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CNTFP26441 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CNTFP26441 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
CNTFP26441 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTFP26441 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTFP26441 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTFP26441 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTFP26441 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTFP26441 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTFP26441 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTFP26441 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNTFP26441 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNTFP26441 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTFP26441 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTFP26441 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTFP26441 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTFP26441 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTFP26441 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CNTFP26441 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTFP26441 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTFP26441 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTFP26441 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTFP26441 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTFP26441 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTFP26441 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTFP26441 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTFP26441 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTFP26441 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTFP26441 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTFP26441 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTFP26441 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTFP26441 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTFP26441 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTFP26441 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTFP26441 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTFP26441 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTFP26441 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTFP26441 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTFP26441 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTFP26441 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTFP26441 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTFP26441 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTFP26441 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTFP26441 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTFP26441 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTFP26441 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTFP26441 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTFP26441 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTFP26441 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTFP26441 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTFP26441 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTFP26441 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTFP26441 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTFP26441 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTFP26441 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTFP26441 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTFP26441 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTFP26441 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTFP26441 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTFP26441 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTFP26441 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTFP26441 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTFP26441 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CNTFP26441 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTFP26441 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTFP26441 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTFP26441 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTFP26441 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTFP26441 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTFP26441 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTFP26441 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTFP26441 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTFP26441 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTFP26441 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTFP26441 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTFP26441 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTFP26441 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTFP26441 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTFP26441 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTFP26441 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTFP26441 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTFP26441 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTFP26441 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTFP26441 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTFP26441 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTFP26441 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTFP26441 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNTFP26441 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNTFP26441 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNTFP26441 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNTFP26441 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTFP26441 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTFP26441 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTFP26441 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTFP26441 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTFP26441 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTFP26441 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTFP26441 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTFP26441 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms