Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA2P17301 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA2P17301 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA2P17301 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA2P17301 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA2P17301 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA2P17301 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA2P17301 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA2P17301 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA2P17301 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA2P17301 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA2P17301 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA2P17301 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA2P17301 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA2P17301 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA2P17301 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA2P17301 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA2P17301 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA2P17301 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA2P17301 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA2P17301 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
ITGA2P17301 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ITGA2P17301 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ITGA2P17301 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA2P17301 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA2P17301 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA2P17301 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA2P17301 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA2P17301 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA2P17301 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA2P17301 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA2P17301 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA2P17301 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA2P17301 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA2P17301 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA2P17301 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA2P17301 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA2P17301 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA2P17301 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA2P17301 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA2P17301 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA2P17301 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA2P17301 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA2P17301 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA2P17301 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA2P17301 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA2P17301 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA2P17301 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA2P17301 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGA2P17301 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA2P17301 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA2P17301 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA2P17301 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA2P17301 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA2P17301 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA2P17301 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA2P17301 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA2P17301 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA2P17301 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA2P17301 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA2P17301 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA2P17301 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA2P17301 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA2P17301 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA2P17301 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA2P17301 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA2P17301 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA2P17301 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA2P17301 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA2P17301 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA2P17301 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA2P17301 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA2P17301 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA2P17301 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITGA2P17301 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA2P17301 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA2P17301 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA2P17301 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA2P17301 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA2P17301 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA2P17301 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA2P17301 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA2P17301 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA2P17301 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA2P17301 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA2P17301 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA2P17301 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA2P17301 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA2P17301 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA2P17301 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA2P17301 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA2P17301 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA2P17301 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA2P17301 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA2P17301 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA2P17301 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA2P17301 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA2P17301 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA2P17301 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA2P17301 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms