Protein–RNA interactions for Protein: P16104

H2AFX, Histone H2AX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFXP16104 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
H2AFXP16104 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
H2AFXP16104 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
H2AFXP16104 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
H2AFXP16104 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
H2AFXP16104 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
H2AFXP16104 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
H2AFXP16104 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
H2AFXP16104 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
H2AFXP16104 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
H2AFXP16104 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
H2AFXP16104 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
H2AFXP16104 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
H2AFXP16104 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
H2AFXP16104 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
H2AFXP16104 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
H2AFXP16104 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
H2AFXP16104 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
H2AFXP16104 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
H2AFXP16104 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
H2AFXP16104 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
H2AFXP16104 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
H2AFXP16104 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
H2AFXP16104 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
H2AFXP16104 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
H2AFXP16104 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
H2AFXP16104 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
H2AFXP16104 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
H2AFXP16104 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
H2AFXP16104 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
H2AFXP16104 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
H2AFXP16104 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
H2AFXP16104 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
H2AFXP16104 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
H2AFXP16104 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
H2AFXP16104 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
H2AFXP16104 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
H2AFXP16104 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
H2AFXP16104 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
H2AFXP16104 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
H2AFXP16104 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
H2AFXP16104 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
H2AFXP16104 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
H2AFXP16104 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
H2AFXP16104 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
H2AFXP16104 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
H2AFXP16104 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
H2AFXP16104 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
H2AFXP16104 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
H2AFXP16104 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
H2AFXP16104 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
H2AFXP16104 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
H2AFXP16104 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
H2AFXP16104 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
H2AFXP16104 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
H2AFXP16104 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
H2AFXP16104 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
H2AFXP16104 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
H2AFXP16104 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
H2AFXP16104 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
H2AFXP16104 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
H2AFXP16104 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
H2AFXP16104 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
H2AFXP16104 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
H2AFXP16104 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
H2AFXP16104 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
H2AFXP16104 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
H2AFXP16104 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
H2AFXP16104 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
H2AFXP16104 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
H2AFXP16104 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
H2AFXP16104 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
H2AFXP16104 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
H2AFXP16104 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
H2AFXP16104 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
H2AFXP16104 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
H2AFXP16104 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
H2AFXP16104 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
H2AFXP16104 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
H2AFXP16104 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
H2AFXP16104 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
H2AFXP16104 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
H2AFXP16104 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
H2AFXP16104 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
H2AFXP16104 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
H2AFXP16104 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
H2AFXP16104 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
H2AFXP16104 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
H2AFXP16104 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
H2AFXP16104 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
H2AFXP16104 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
H2AFXP16104 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
H2AFXP16104 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
H2AFXP16104 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
H2AFXP16104 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
H2AFXP16104 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
H2AFXP16104 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
H2AFXP16104 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
H2AFXP16104 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
H2AFXP16104 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms