Protein–RNA interactions for Protein: P0C866

LINC00869, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00869, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00869P0C866 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00869P0C866 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00869P0C866 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00869P0C866 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00869P0C866 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00869P0C866 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00869P0C866 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00869P0C866 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00869P0C866 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00869P0C866 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00869P0C866 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00869P0C866 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00869P0C866 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00869P0C866 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00869P0C866 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00869P0C866 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00869P0C866 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00869P0C866 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00869P0C866 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00869P0C866 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00869P0C866 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00869P0C866 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00869P0C866 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00869P0C866 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00869P0C866 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00869P0C866 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00869P0C866 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00869P0C866 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00869P0C866 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00869P0C866 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00869P0C866 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00869P0C866 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00869P0C866 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00869P0C866 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00869P0C866 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00869P0C866 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00869P0C866 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00869P0C866 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00869P0C866 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00869P0C866 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00869P0C866 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00869P0C866 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00869P0C866 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00869P0C866 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00869P0C866 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00869P0C866 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00869P0C866 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00869P0C866 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00869P0C866 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00869P0C866 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00869P0C866 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00869P0C866 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00869P0C866 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00869P0C866 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00869P0C866 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
LINC00869P0C866 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00869P0C866 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00869P0C866 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00869P0C866 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00869P0C866 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00869P0C866 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00869P0C866 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00869P0C866 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00869P0C866 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00869P0C866 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00869P0C866 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00869P0C866 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00869P0C866 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00869P0C866 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00869P0C866 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00869P0C866 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00869P0C866 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00869P0C866 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00869P0C866 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00869P0C866 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00869P0C866 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00869P0C866 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00869P0C866 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00869P0C866 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00869P0C866 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00869P0C866 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00869P0C866 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00869P0C866 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00869P0C866 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00869P0C866 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00869P0C866 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00869P0C866 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00869P0C866 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00869P0C866 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00869P0C866 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00869P0C866 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00869P0C866 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00869P0C866 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00869P0C866 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00869P0C866 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00869P0C866 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00869P0C866 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00869P0C866 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00869P0C866 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00869P0C866 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms