Protein–RNA interactions for Protein: P07305

H1F0, Histone H1.0, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H1F0P07305 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
H1F0P07305 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H1F0P07305 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
H1F0P07305 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H1F0P07305 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
H1F0P07305 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H1F0P07305 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
H1F0P07305 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H1F0P07305 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
H1F0P07305 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H1F0P07305 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H1F0P07305 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H1F0P07305 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H1F0P07305 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H1F0P07305 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
H1F0P07305 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
H1F0P07305 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H1F0P07305 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
H1F0P07305 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H1F0P07305 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H1F0P07305 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H1F0P07305 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H1F0P07305 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H1F0P07305 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
H1F0P07305 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
H1F0P07305 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
H1F0P07305 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
H1F0P07305 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H1F0P07305 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
H1F0P07305 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H1F0P07305 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
H1F0P07305 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H1F0P07305 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H1F0P07305 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H1F0P07305 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
H1F0P07305 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
H1F0P07305 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
H1F0P07305 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
H1F0P07305 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
H1F0P07305 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H1F0P07305 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
H1F0P07305 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H1F0P07305 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
H1F0P07305 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
H1F0P07305 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H1F0P07305 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
H1F0P07305 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H1F0P07305 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H1F0P07305 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
H1F0P07305 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H1F0P07305 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H1F0P07305 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
H1F0P07305 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
H1F0P07305 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H1F0P07305 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H1F0P07305 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H1F0P07305 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
H1F0P07305 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H1F0P07305 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H1F0P07305 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H1F0P07305 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
H1F0P07305 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H1F0P07305 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H1F0P07305 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H1F0P07305 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H1F0P07305 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H1F0P07305 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
H1F0P07305 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
H1F0P07305 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H1F0P07305 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H1F0P07305 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H1F0P07305 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H1F0P07305 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H1F0P07305 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H1F0P07305 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H1F0P07305 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H1F0P07305 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H1F0P07305 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
H1F0P07305 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H1F0P07305 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H1F0P07305 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
H1F0P07305 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H1F0P07305 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H1F0P07305 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H1F0P07305 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
H1F0P07305 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
H1F0P07305 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H1F0P07305 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H1F0P07305 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H1F0P07305 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H1F0P07305 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
H1F0P07305 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
H1F0P07305 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
H1F0P07305 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
H1F0P07305 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
H1F0P07305 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H1F0P07305 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
H1F0P07305 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
H1F0P07305 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H1F0P07305 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms