Protein–RNA interactions for Protein: P06401

PGR, Progesterone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGRP06401 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PGRP06401 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PGRP06401 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PGRP06401 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGRP06401 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGRP06401 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGRP06401 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGRP06401 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGRP06401 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGRP06401 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGRP06401 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGRP06401 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGRP06401 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGRP06401 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGRP06401 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGRP06401 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGRP06401 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGRP06401 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGRP06401 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGRP06401 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGRP06401 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGRP06401 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PGRP06401 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGRP06401 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGRP06401 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGRP06401 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGRP06401 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PGRP06401 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PGRP06401 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PGRP06401 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGRP06401 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGRP06401 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGRP06401 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGRP06401 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PGRP06401 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGRP06401 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGRP06401 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGRP06401 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGRP06401 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGRP06401 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGRP06401 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGRP06401 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGRP06401 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGRP06401 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGRP06401 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGRP06401 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGRP06401 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGRP06401 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGRP06401 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGRP06401 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGRP06401 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGRP06401 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGRP06401 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGRP06401 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGRP06401 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGRP06401 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGRP06401 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGRP06401 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGRP06401 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGRP06401 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGRP06401 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGRP06401 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGRP06401 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGRP06401 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGRP06401 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGRP06401 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGRP06401 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGRP06401 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGRP06401 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGRP06401 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGRP06401 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGRP06401 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGRP06401 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGRP06401 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGRP06401 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGRP06401 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGRP06401 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGRP06401 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGRP06401 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PGRP06401 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
PGRP06401 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PGRP06401 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGRP06401 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGRP06401 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGRP06401 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGRP06401 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGRP06401 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGRP06401 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGRP06401 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGRP06401 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGRP06401 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGRP06401 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGRP06401 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGRP06401 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGRP06401 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGRP06401 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGRP06401 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGRP06401 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGRP06401 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGRP06401 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms