Protein–RNA interactions for Protein: P05549

TFAP2A, Transcription factor AP-2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2AP05549 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TFAP2AP05549 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TFAP2AP05549 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TFAP2AP05549 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TFAP2AP05549 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TFAP2AP05549 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TFAP2AP05549 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TFAP2AP05549 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFAP2AP05549 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFAP2AP05549 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFAP2AP05549 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFAP2AP05549 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFAP2AP05549 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFAP2AP05549 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFAP2AP05549 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFAP2AP05549 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFAP2AP05549 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFAP2AP05549 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFAP2AP05549 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFAP2AP05549 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFAP2AP05549 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFAP2AP05549 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFAP2AP05549 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFAP2AP05549 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFAP2AP05549 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFAP2AP05549 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFAP2AP05549 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFAP2AP05549 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFAP2AP05549 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFAP2AP05549 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFAP2AP05549 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFAP2AP05549 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFAP2AP05549 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFAP2AP05549 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFAP2AP05549 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TFAP2AP05549 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TFAP2AP05549 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TFAP2AP05549 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TFAP2AP05549 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFAP2AP05549 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFAP2AP05549 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFAP2AP05549 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFAP2AP05549 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFAP2AP05549 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFAP2AP05549 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFAP2AP05549 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TFAP2AP05549 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFAP2AP05549 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFAP2AP05549 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFAP2AP05549 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFAP2AP05549 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFAP2AP05549 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFAP2AP05549 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFAP2AP05549 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFAP2AP05549 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFAP2AP05549 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFAP2AP05549 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFAP2AP05549 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFAP2AP05549 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFAP2AP05549 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFAP2AP05549 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFAP2AP05549 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFAP2AP05549 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TFAP2AP05549 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFAP2AP05549 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFAP2AP05549 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFAP2AP05549 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFAP2AP05549 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFAP2AP05549 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFAP2AP05549 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFAP2AP05549 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFAP2AP05549 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFAP2AP05549 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFAP2AP05549 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFAP2AP05549 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFAP2AP05549 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TFAP2AP05549 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TFAP2AP05549 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFAP2AP05549 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFAP2AP05549 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFAP2AP05549 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFAP2AP05549 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFAP2AP05549 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFAP2AP05549 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFAP2AP05549 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFAP2AP05549 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFAP2AP05549 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFAP2AP05549 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFAP2AP05549 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFAP2AP05549 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFAP2AP05549 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFAP2AP05549 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFAP2AP05549 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFAP2AP05549 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFAP2AP05549 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFAP2AP05549 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFAP2AP05549 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFAP2AP05549 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFAP2AP05549 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFAP2AP05549 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms