Protein–RNA interactions for Protein: P02679

FGG, Fibrinogen gamma chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGGP02679 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGGP02679 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGGP02679 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGGP02679 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGGP02679 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGGP02679 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGGP02679 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FGGP02679 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FGGP02679 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGGP02679 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGGP02679 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
FGGP02679 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGGP02679 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGGP02679 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FGGP02679 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FGGP02679 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
FGGP02679 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
FGGP02679 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FGGP02679 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FGGP02679 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FGGP02679 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FGGP02679 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FGGP02679 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FGGP02679 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FGGP02679 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FGGP02679 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FGGP02679 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FGGP02679 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FGGP02679 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
FGGP02679 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FGGP02679 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FGGP02679 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FGGP02679 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGGP02679 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGGP02679 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGGP02679 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGGP02679 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGGP02679 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FGGP02679 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FGGP02679 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FGGP02679 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FGGP02679 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FGGP02679 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
FGGP02679 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGGP02679 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGGP02679 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGGP02679 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGGP02679 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FGGP02679 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FGGP02679 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FGGP02679 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FGGP02679 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FGGP02679 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FGGP02679 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FGGP02679 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FGGP02679 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FGGP02679 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FGGP02679 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FGGP02679 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FGGP02679 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FGGP02679 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
FGGP02679 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FGGP02679 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
FGGP02679 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FGGP02679 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FGGP02679 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FGGP02679 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FGGP02679 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FGGP02679 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FGGP02679 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FGGP02679 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FGGP02679 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FGGP02679 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FGGP02679 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FGGP02679 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FGGP02679 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FGGP02679 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FGGP02679 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FGGP02679 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FGGP02679 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FGGP02679 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FGGP02679 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FGGP02679 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
FGGP02679 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGGP02679 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGGP02679 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGGP02679 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGGP02679 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGGP02679 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGGP02679 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGGP02679 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGGP02679 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGGP02679 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGGP02679 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGGP02679 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGGP02679 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGGP02679 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGGP02679 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
FGGP02679 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGGP02679 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.5 ms