Protein–RNA interactions for Protein: P01730

CD4, T-cell surface glycoprotein CD4, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD4P01730 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CD4P01730 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CD4P01730 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CD4P01730 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CD4P01730 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CD4P01730 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CD4P01730 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CD4P01730 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CD4P01730 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CD4P01730 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CD4P01730 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CD4P01730 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CD4P01730 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD4P01730 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD4P01730 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD4P01730 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD4P01730 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD4P01730 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CD4P01730 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CD4P01730 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CD4P01730 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CD4P01730 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CD4P01730 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CD4P01730 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CD4P01730 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CD4P01730 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CD4P01730 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CD4P01730 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CD4P01730 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CD4P01730 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CD4P01730 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CD4P01730 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CD4P01730 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CD4P01730 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CD4P01730 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CD4P01730 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CD4P01730 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CD4P01730 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CD4P01730 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CD4P01730 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CD4P01730 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CD4P01730 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CD4P01730 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CD4P01730 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CD4P01730 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CD4P01730 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CD4P01730 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CD4P01730 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CD4P01730 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CD4P01730 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CD4P01730 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CD4P01730 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CD4P01730 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CD4P01730 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CD4P01730 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CD4P01730 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CD4P01730 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CD4P01730 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CD4P01730 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CD4P01730 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CD4P01730 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CD4P01730 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CD4P01730 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CD4P01730 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CD4P01730 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CD4P01730 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CD4P01730 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CD4P01730 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CD4P01730 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CD4P01730 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CD4P01730 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CD4P01730 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CD4P01730 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CD4P01730 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CD4P01730 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CD4P01730 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CD4P01730 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CD4P01730 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CD4P01730 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CD4P01730 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CD4P01730 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CD4P01730 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CD4P01730 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CD4P01730 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CD4P01730 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CD4P01730 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CD4P01730 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CD4P01730 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CD4P01730 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CD4P01730 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CD4P01730 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CD4P01730 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CD4P01730 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CD4P01730 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CD4P01730 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CD4P01730 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CD4P01730 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CD4P01730 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CD4P01730 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CD4P01730 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms