Protein–RNA interactions for Protein: O95630

STAMBP, STAM-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPO95630 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STAMBPO95630 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STAMBPO95630 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STAMBPO95630 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STAMBPO95630 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STAMBPO95630 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STAMBPO95630 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STAMBPO95630 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STAMBPO95630 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STAMBPO95630 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STAMBPO95630 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STAMBPO95630 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STAMBPO95630 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STAMBPO95630 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STAMBPO95630 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STAMBPO95630 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STAMBPO95630 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STAMBPO95630 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STAMBPO95630 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STAMBPO95630 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STAMBPO95630 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STAMBPO95630 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STAMBPO95630 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STAMBPO95630 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STAMBPO95630 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STAMBPO95630 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STAMBPO95630 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STAMBPO95630 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STAMBPO95630 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STAMBPO95630 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STAMBPO95630 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STAMBPO95630 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STAMBPO95630 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STAMBPO95630 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STAMBPO95630 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
STAMBPO95630 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STAMBPO95630 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
STAMBPO95630 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STAMBPO95630 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
STAMBPO95630 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STAMBPO95630 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STAMBPO95630 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STAMBPO95630 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STAMBPO95630 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
STAMBPO95630 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STAMBPO95630 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STAMBPO95630 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STAMBPO95630 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STAMBPO95630 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STAMBPO95630 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STAMBPO95630 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STAMBPO95630 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STAMBPO95630 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STAMBPO95630 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STAMBPO95630 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STAMBPO95630 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STAMBPO95630 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STAMBPO95630 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STAMBPO95630 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STAMBPO95630 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STAMBPO95630 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STAMBPO95630 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STAMBPO95630 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STAMBPO95630 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STAMBPO95630 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STAMBPO95630 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STAMBPO95630 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STAMBPO95630 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STAMBPO95630 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STAMBPO95630 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STAMBPO95630 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STAMBPO95630 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STAMBPO95630 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
STAMBPO95630 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STAMBPO95630 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STAMBPO95630 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STAMBPO95630 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STAMBPO95630 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STAMBPO95630 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STAMBPO95630 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STAMBPO95630 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STAMBPO95630 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STAMBPO95630 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STAMBPO95630 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STAMBPO95630 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STAMBPO95630 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
STAMBPO95630 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STAMBPO95630 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STAMBPO95630 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STAMBPO95630 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STAMBPO95630 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STAMBPO95630 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STAMBPO95630 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STAMBPO95630 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STAMBPO95630 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STAMBPO95630 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STAMBPO95630 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STAMBPO95630 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STAMBPO95630 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
STAMBPO95630 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms