Protein–RNA interactions for Protein: O94953

KDM4B, Lysine-specific demethylase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4BO94953 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM4BO94953 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM4BO94953 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM4BO94953 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM4BO94953 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM4BO94953 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM4BO94953 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM4BO94953 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM4BO94953 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM4BO94953 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM4BO94953 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM4BO94953 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM4BO94953 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM4BO94953 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM4BO94953 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KDM4BO94953 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM4BO94953 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM4BO94953 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM4BO94953 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM4BO94953 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM4BO94953 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM4BO94953 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM4BO94953 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM4BO94953 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM4BO94953 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM4BO94953 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM4BO94953 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM4BO94953 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM4BO94953 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM4BO94953 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM4BO94953 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM4BO94953 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM4BO94953 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM4BO94953 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM4BO94953 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM4BO94953 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM4BO94953 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM4BO94953 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM4BO94953 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM4BO94953 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM4BO94953 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4BO94953 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4BO94953 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4BO94953 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4BO94953 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4BO94953 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4BO94953 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM4BO94953 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM4BO94953 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM4BO94953 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM4BO94953 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM4BO94953 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM4BO94953 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM4BO94953 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM4BO94953 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM4BO94953 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM4BO94953 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM4BO94953 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM4BO94953 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM4BO94953 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM4BO94953 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM4BO94953 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM4BO94953 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM4BO94953 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM4BO94953 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM4BO94953 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4BO94953 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4BO94953 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4BO94953 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4BO94953 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4BO94953 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM4BO94953 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4BO94953 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4BO94953 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4BO94953 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4BO94953 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4BO94953 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4BO94953 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM4BO94953 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM4BO94953 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM4BO94953 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM4BO94953 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM4BO94953 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM4BO94953 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4BO94953 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4BO94953 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4BO94953 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4BO94953 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4BO94953 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM4BO94953 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM4BO94953 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM4BO94953 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM4BO94953 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM4BO94953 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM4BO94953 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM4BO94953 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM4BO94953 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM4BO94953 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM4BO94953 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM4BO94953 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms