Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GMDSO60547 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GMDSO60547 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GMDSO60547 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GMDSO60547 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GMDSO60547 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GMDSO60547 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GMDSO60547 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GMDSO60547 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GMDSO60547 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GMDSO60547 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GMDSO60547 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GMDSO60547 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GMDSO60547 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GMDSO60547 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GMDSO60547 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GMDSO60547 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GMDSO60547 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GMDSO60547 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GMDSO60547 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GMDSO60547 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GMDSO60547 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GMDSO60547 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GMDSO60547 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GMDSO60547 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GMDSO60547 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GMDSO60547 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GMDSO60547 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GMDSO60547 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GMDSO60547 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GMDSO60547 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GMDSO60547 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GMDSO60547 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GMDSO60547 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GMDSO60547 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GMDSO60547 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GMDSO60547 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GMDSO60547 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GMDSO60547 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GMDSO60547 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GMDSO60547 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GMDSO60547 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GMDSO60547 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GMDSO60547 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GMDSO60547 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GMDSO60547 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GMDSO60547 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GMDSO60547 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GMDSO60547 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GMDSO60547 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GMDSO60547 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GMDSO60547 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GMDSO60547 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GMDSO60547 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GMDSO60547 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GMDSO60547 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GMDSO60547 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GMDSO60547 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GMDSO60547 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GMDSO60547 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GMDSO60547 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GMDSO60547 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GMDSO60547 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GMDSO60547 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GMDSO60547 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GMDSO60547 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GMDSO60547 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GMDSO60547 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GMDSO60547 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GMDSO60547 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GMDSO60547 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GMDSO60547 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GMDSO60547 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GMDSO60547 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GMDSO60547 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GMDSO60547 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GMDSO60547 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GMDSO60547 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GMDSO60547 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GMDSO60547 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GMDSO60547 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
GMDSO60547 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GMDSO60547 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GMDSO60547 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GMDSO60547 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GMDSO60547 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GMDSO60547 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GMDSO60547 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GMDSO60547 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GMDSO60547 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GMDSO60547 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GMDSO60547 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GMDSO60547 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GMDSO60547 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GMDSO60547 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GMDSO60547 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GMDSO60547 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GMDSO60547 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GMDSO60547 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GMDSO60547 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms