Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRODHO43272 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRODHO43272 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRODHO43272 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRODHO43272 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRODHO43272 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRODHO43272 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRODHO43272 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRODHO43272 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRODHO43272 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRODHO43272 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRODHO43272 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRODHO43272 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRODHO43272 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRODHO43272 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRODHO43272 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRODHO43272 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRODHO43272 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRODHO43272 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRODHO43272 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRODHO43272 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRODHO43272 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRODHO43272 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRODHO43272 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRODHO43272 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRODHO43272 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PRODHO43272 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRODHO43272 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRODHO43272 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRODHO43272 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRODHO43272 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRODHO43272 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRODHO43272 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRODHO43272 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRODHO43272 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRODHO43272 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRODHO43272 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRODHO43272 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRODHO43272 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRODHO43272 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRODHO43272 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRODHO43272 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRODHO43272 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRODHO43272 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRODHO43272 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRODHO43272 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRODHO43272 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PRODHO43272 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRODHO43272 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRODHO43272 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRODHO43272 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRODHO43272 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRODHO43272 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRODHO43272 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRODHO43272 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRODHO43272 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRODHO43272 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRODHO43272 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRODHO43272 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRODHO43272 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PRODHO43272 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRODHO43272 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRODHO43272 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRODHO43272 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PRODHO43272 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRODHO43272 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRODHO43272 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRODHO43272 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRODHO43272 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRODHO43272 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRODHO43272 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRODHO43272 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRODHO43272 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRODHO43272 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRODHO43272 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRODHO43272 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRODHO43272 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRODHO43272 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRODHO43272 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRODHO43272 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRODHO43272 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRODHO43272 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRODHO43272 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRODHO43272 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRODHO43272 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRODHO43272 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRODHO43272 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRODHO43272 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRODHO43272 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRODHO43272 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRODHO43272 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRODHO43272 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRODHO43272 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRODHO43272 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRODHO43272 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PRODHO43272 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRODHO43272 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRODHO43272 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRODHO43272 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRODHO43272 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms