Protein–RNA interactions for Protein: J3KTA2

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KTA2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
J3KTA2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
J3KTA2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
J3KTA2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
J3KTA2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
J3KTA2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
J3KTA2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
J3KTA2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
J3KTA2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
J3KTA2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
J3KTA2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
J3KTA2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
J3KTA2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
J3KTA2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
J3KTA2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
J3KTA2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
J3KTA2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
J3KTA2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
J3KTA2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
J3KTA2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
J3KTA2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
J3KTA2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
J3KTA2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
J3KTA2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
J3KTA2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
J3KTA2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
J3KTA2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
J3KTA2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
J3KTA2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
J3KTA2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
J3KTA2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
J3KTA2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
J3KTA2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
J3KTA2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
J3KTA2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
J3KTA2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
J3KTA2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
J3KTA2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
J3KTA2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
J3KTA2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
J3KTA2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
J3KTA2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
J3KTA2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
J3KTA2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
J3KTA2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
J3KTA2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
J3KTA2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
J3KTA2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
J3KTA2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
J3KTA2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
J3KTA2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
J3KTA2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
J3KTA2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
J3KTA2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
J3KTA2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
J3KTA2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
J3KTA2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
J3KTA2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
J3KTA2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
J3KTA2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
J3KTA2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
J3KTA2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
J3KTA2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
J3KTA2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
J3KTA2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
J3KTA2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
J3KTA2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
J3KTA2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
J3KTA2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
J3KTA2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
J3KTA2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
J3KTA2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
J3KTA2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
J3KTA2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
J3KTA2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
J3KTA2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
J3KTA2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
J3KTA2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
J3KTA2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
J3KTA2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
J3KTA2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
J3KTA2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
J3KTA2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
J3KTA2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
J3KTA2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
J3KTA2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
J3KTA2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
J3KTA2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
J3KTA2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
J3KTA2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
J3KTA2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
J3KTA2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
J3KTA2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
J3KTA2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
J3KTA2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
J3KTA2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
J3KTA2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
J3KTA2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
J3KTA2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
J3KTA2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms