Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BHMG1C9JSJ3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BHMG1C9JSJ3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BHMG1C9JSJ3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BHMG1C9JSJ3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BHMG1C9JSJ3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BHMG1C9JSJ3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
BHMG1C9JSJ3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BHMG1C9JSJ3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BHMG1C9JSJ3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BHMG1C9JSJ3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BHMG1C9JSJ3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BHMG1C9JSJ3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BHMG1C9JSJ3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BHMG1C9JSJ3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BHMG1C9JSJ3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BHMG1C9JSJ3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
BHMG1C9JSJ3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BHMG1C9JSJ3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BHMG1C9JSJ3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BHMG1C9JSJ3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BHMG1C9JSJ3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BHMG1C9JSJ3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BHMG1C9JSJ3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BHMG1C9JSJ3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BHMG1C9JSJ3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BHMG1C9JSJ3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BHMG1C9JSJ3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
BHMG1C9JSJ3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BHMG1C9JSJ3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BHMG1C9JSJ3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BHMG1C9JSJ3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BHMG1C9JSJ3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BHMG1C9JSJ3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BHMG1C9JSJ3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BHMG1C9JSJ3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
BHMG1C9JSJ3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BHMG1C9JSJ3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BHMG1C9JSJ3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BHMG1C9JSJ3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BHMG1C9JSJ3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BHMG1C9JSJ3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BHMG1C9JSJ3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BHMG1C9JSJ3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BHMG1C9JSJ3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BHMG1C9JSJ3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BHMG1C9JSJ3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BHMG1C9JSJ3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BHMG1C9JSJ3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BHMG1C9JSJ3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BHMG1C9JSJ3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BHMG1C9JSJ3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BHMG1C9JSJ3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BHMG1C9JSJ3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BHMG1C9JSJ3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BHMG1C9JSJ3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BHMG1C9JSJ3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BHMG1C9JSJ3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BHMG1C9JSJ3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
BHMG1C9JSJ3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BHMG1C9JSJ3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BHMG1C9JSJ3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BHMG1C9JSJ3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BHMG1C9JSJ3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
BHMG1C9JSJ3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BHMG1C9JSJ3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BHMG1C9JSJ3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BHMG1C9JSJ3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BHMG1C9JSJ3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BHMG1C9JSJ3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BHMG1C9JSJ3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BHMG1C9JSJ3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BHMG1C9JSJ3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BHMG1C9JSJ3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BHMG1C9JSJ3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BHMG1C9JSJ3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BHMG1C9JSJ3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BHMG1C9JSJ3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
BHMG1C9JSJ3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BHMG1C9JSJ3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BHMG1C9JSJ3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BHMG1C9JSJ3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BHMG1C9JSJ3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
BHMG1C9JSJ3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BHMG1C9JSJ3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BHMG1C9JSJ3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BHMG1C9JSJ3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BHMG1C9JSJ3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BHMG1C9JSJ3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BHMG1C9JSJ3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BHMG1C9JSJ3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BHMG1C9JSJ3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BHMG1C9JSJ3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BHMG1C9JSJ3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BHMG1C9JSJ3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BHMG1C9JSJ3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BHMG1C9JSJ3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BHMG1C9JSJ3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BHMG1C9JSJ3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BHMG1C9JSJ3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms