Protein–RNA interactions for Protein: A6NFR6

C5orf60, Putative uncharacterized protein C5orf60, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf60A6NFR6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C5orf60A6NFR6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
C5orf60A6NFR6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C5orf60A6NFR6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C5orf60A6NFR6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C5orf60A6NFR6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C5orf60A6NFR6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C5orf60A6NFR6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C5orf60A6NFR6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C5orf60A6NFR6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
C5orf60A6NFR6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C5orf60A6NFR6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C5orf60A6NFR6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C5orf60A6NFR6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
C5orf60A6NFR6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
C5orf60A6NFR6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
C5orf60A6NFR6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
C5orf60A6NFR6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
C5orf60A6NFR6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C5orf60A6NFR6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C5orf60A6NFR6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C5orf60A6NFR6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
C5orf60A6NFR6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
C5orf60A6NFR6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
C5orf60A6NFR6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
C5orf60A6NFR6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C5orf60A6NFR6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C5orf60A6NFR6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C5orf60A6NFR6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
C5orf60A6NFR6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C5orf60A6NFR6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
C5orf60A6NFR6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C5orf60A6NFR6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
C5orf60A6NFR6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
C5orf60A6NFR6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
C5orf60A6NFR6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
C5orf60A6NFR6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C5orf60A6NFR6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
C5orf60A6NFR6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
C5orf60A6NFR6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
C5orf60A6NFR6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
C5orf60A6NFR6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
C5orf60A6NFR6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
C5orf60A6NFR6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
C5orf60A6NFR6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
C5orf60A6NFR6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
C5orf60A6NFR6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
C5orf60A6NFR6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
C5orf60A6NFR6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
C5orf60A6NFR6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
C5orf60A6NFR6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
C5orf60A6NFR6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
C5orf60A6NFR6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
C5orf60A6NFR6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
C5orf60A6NFR6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
C5orf60A6NFR6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
C5orf60A6NFR6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
C5orf60A6NFR6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
C5orf60A6NFR6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
C5orf60A6NFR6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
C5orf60A6NFR6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
C5orf60A6NFR6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
C5orf60A6NFR6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C5orf60A6NFR6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
C5orf60A6NFR6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
C5orf60A6NFR6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
C5orf60A6NFR6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
C5orf60A6NFR6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
C5orf60A6NFR6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
C5orf60A6NFR6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
C5orf60A6NFR6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C5orf60A6NFR6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C5orf60A6NFR6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
C5orf60A6NFR6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
C5orf60A6NFR6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C5orf60A6NFR6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
C5orf60A6NFR6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
C5orf60A6NFR6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
C5orf60A6NFR6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
C5orf60A6NFR6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C5orf60A6NFR6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C5orf60A6NFR6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C5orf60A6NFR6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C5orf60A6NFR6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
C5orf60A6NFR6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
C5orf60A6NFR6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
C5orf60A6NFR6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
C5orf60A6NFR6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
C5orf60A6NFR6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C5orf60A6NFR6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C5orf60A6NFR6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
C5orf60A6NFR6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C5orf60A6NFR6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C5orf60A6NFR6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C5orf60A6NFR6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C5orf60A6NFR6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C5orf60A6NFR6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C5orf60A6NFR6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C5orf60A6NFR6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C5orf60A6NFR6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms