Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HMX2A2RU54 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HMX2A2RU54 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HMX2A2RU54 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HMX2A2RU54 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HMX2A2RU54 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HMX2A2RU54 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HMX2A2RU54 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HMX2A2RU54 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HMX2A2RU54 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HMX2A2RU54 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HMX2A2RU54 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HMX2A2RU54 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HMX2A2RU54 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HMX2A2RU54 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMX2A2RU54 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMX2A2RU54 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMX2A2RU54 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HMX2A2RU54 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HMX2A2RU54 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HMX2A2RU54 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMX2A2RU54 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMX2A2RU54 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMX2A2RU54 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMX2A2RU54 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMX2A2RU54 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HMX2A2RU54 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HMX2A2RU54 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HMX2A2RU54 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HMX2A2RU54 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMX2A2RU54 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMX2A2RU54 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMX2A2RU54 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMX2A2RU54 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMX2A2RU54 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMX2A2RU54 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMX2A2RU54 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMX2A2RU54 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMX2A2RU54 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMX2A2RU54 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HMX2A2RU54 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HMX2A2RU54 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HMX2A2RU54 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMX2A2RU54 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMX2A2RU54 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMX2A2RU54 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMX2A2RU54 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMX2A2RU54 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMX2A2RU54 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMX2A2RU54 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMX2A2RU54 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMX2A2RU54 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMX2A2RU54 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMX2A2RU54 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMX2A2RU54 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMX2A2RU54 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMX2A2RU54 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMX2A2RU54 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMX2A2RU54 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMX2A2RU54 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMX2A2RU54 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMX2A2RU54 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMX2A2RU54 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMX2A2RU54 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMX2A2RU54 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMX2A2RU54 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMX2A2RU54 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HMX2A2RU54 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HMX2A2RU54 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMX2A2RU54 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMX2A2RU54 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMX2A2RU54 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMX2A2RU54 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HMX2A2RU54 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HMX2A2RU54 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HMX2A2RU54 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HMX2A2RU54 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HMX2A2RU54 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMX2A2RU54 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMX2A2RU54 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMX2A2RU54 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HMX2A2RU54 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMX2A2RU54 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMX2A2RU54 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMX2A2RU54 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMX2A2RU54 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMX2A2RU54 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMX2A2RU54 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMX2A2RU54 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HMX2A2RU54 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HMX2A2RU54 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HMX2A2RU54 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HMX2A2RU54 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HMX2A2RU54 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HMX2A2RU54 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HMX2A2RU54 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMX2A2RU54 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMX2A2RU54 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMX2A2RU54 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMX2A2RU54 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms