Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEFLP07196 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEFLP07196 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEFLP07196 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEFLP07196 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEFLP07196 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEFLP07196 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEFLP07196 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEFLP07196 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEFLP07196 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEFLP07196 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEFLP07196 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEFLP07196 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEFLP07196 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEFLP07196 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEFLP07196 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEFLP07196 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEFLP07196 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEFLP07196 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEFLP07196 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEFLP07196 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEFLP07196 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEFLP07196 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NEFLP07196 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NEFLP07196 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEFLP07196 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEFLP07196 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEFLP07196 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEFLP07196 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEFLP07196 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEFLP07196 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEFLP07196 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEFLP07196 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEFLP07196 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEFLP07196 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEFLP07196 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEFLP07196 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEFLP07196 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEFLP07196 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEFLP07196 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEFLP07196 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEFLP07196 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEFLP07196 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NEFLP07196 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEFLP07196 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEFLP07196 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEFLP07196 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEFLP07196 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NEFLP07196 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NEFLP07196 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEFLP07196 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEFLP07196 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEFLP07196 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEFLP07196 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEFLP07196 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEFLP07196 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEFLP07196 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEFLP07196 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NEFLP07196 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEFLP07196 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEFLP07196 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEFLP07196 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEFLP07196 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEFLP07196 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEFLP07196 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEFLP07196 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEFLP07196 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEFLP07196 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEFLP07196 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEFLP07196 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEFLP07196 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEFLP07196 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEFLP07196 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEFLP07196 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEFLP07196 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEFLP07196 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEFLP07196 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEFLP07196 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEFLP07196 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEFLP07196 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEFLP07196 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEFLP07196 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEFLP07196 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEFLP07196 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEFLP07196 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEFLP07196 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEFLP07196 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEFLP07196 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEFLP07196 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEFLP07196 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NEFLP07196 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEFLP07196 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEFLP07196 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEFLP07196 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NEFLP07196 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEFLP07196 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEFLP07196 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEFLP07196 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEFLP07196 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEFLP07196 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms