Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms