Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms