Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIF1AQ16665 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HIF1AQ16665 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HIF1AQ16665 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HIF1AQ16665 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HIF1AQ16665 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HIF1AQ16665 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HIF1AQ16665 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
HIF1AQ16665 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIF1AQ16665 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIF1AQ16665 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIF1AQ16665 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIF1AQ16665 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIF1AQ16665 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIF1AQ16665 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIF1AQ16665 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIF1AQ16665 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIF1AQ16665 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIF1AQ16665 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIF1AQ16665 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIF1AQ16665 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIF1AQ16665 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIF1AQ16665 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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