Protein–RNA interactions for Protein: P86478

PRR20E, Proline-rich protein 20E, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR20EP86478 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRR20EP86478 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms