Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARFGEF2Q9Y6D5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARFGEF2Q9Y6D5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARFGEF2Q9Y6D5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARFGEF2Q9Y6D5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARFGEF2Q9Y6D5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARFGEF2Q9Y6D5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARFGEF2Q9Y6D5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARFGEF2Q9Y6D5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARFGEF2Q9Y6D5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFGEF2Q9Y6D5 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFGEF2Q9Y6D5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFGEF2Q9Y6D5 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFGEF2Q9Y6D5 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFGEF2Q9Y6D5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFGEF2Q9Y6D5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFGEF2Q9Y6D5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFGEF2Q9Y6D5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFGEF2Q9Y6D5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFGEF2Q9Y6D5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFGEF2Q9Y6D5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFGEF2Q9Y6D5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFGEF2Q9Y6D5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFGEF2Q9Y6D5 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFGEF2Q9Y6D5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFGEF2Q9Y6D5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFGEF2Q9Y6D5 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFGEF2Q9Y6D5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFGEF2Q9Y6D5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFGEF2Q9Y6D5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARFGEF2Q9Y6D5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARFGEF2Q9Y6D5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARFGEF2Q9Y6D5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARFGEF2Q9Y6D5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARFGEF2Q9Y6D5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARFGEF2Q9Y6D5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARFGEF2Q9Y6D5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARFGEF2Q9Y6D5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARFGEF2Q9Y6D5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARFGEF2Q9Y6D5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARFGEF2Q9Y6D5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARFGEF2Q9Y6D5 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms