Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms