Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00205P59089 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.8 ms