Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms