Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPREB3Q9UKI3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms