Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.5 ms