Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC63Q05C16 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms