Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SEC24CP53992 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SEC24CP53992 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SEC24CP53992 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEC24CP53992 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEC24CP53992 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEC24CP53992 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEC24CP53992 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEC24CP53992 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEC24CP53992 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEC24CP53992 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEC24CP53992 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEC24CP53992 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEC24CP53992 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEC24CP53992 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEC24CP53992 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEC24CP53992 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEC24CP53992 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEC24CP53992 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEC24CP53992 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEC24CP53992 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEC24CP53992 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEC24CP53992 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEC24CP53992 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEC24CP53992 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEC24CP53992 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEC24CP53992 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEC24CP53992 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEC24CP53992 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEC24CP53992 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEC24CP53992 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEC24CP53992 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEC24CP53992 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEC24CP53992 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEC24CP53992 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms