Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PHKA1P46020 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms