Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
J3KRW8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
J3KRW8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
J3KRW8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
J3KRW8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
J3KRW8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
J3KRW8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
J3KRW8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
J3KRW8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
J3KRW8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
J3KRW8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
J3KRW8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
J3KRW8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
J3KRW8 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
J3KRW8 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
J3KRW8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
J3KRW8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
J3KRW8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
J3KRW8 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
J3KRW8 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
J3KRW8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
J3KRW8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
J3KRW8 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
J3KRW8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
J3KRW8 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
J3KRW8 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
J3KRW8 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
J3KRW8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
J3KRW8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
J3KRW8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
J3KRW8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
J3KRW8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
J3KRW8 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
J3KRW8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
J3KRW8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
J3KRW8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
J3KRW8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
J3KRW8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
J3KRW8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
J3KRW8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
J3KRW8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
J3KRW8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
J3KRW8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
J3KRW8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
J3KRW8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
J3KRW8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
J3KRW8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
J3KRW8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
J3KRW8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
J3KRW8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
J3KRW8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
J3KRW8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
J3KRW8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
J3KRW8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
J3KRW8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
J3KRW8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
J3KRW8 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
J3KRW8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
J3KRW8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
J3KRW8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
J3KRW8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
J3KRW8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
J3KRW8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
J3KRW8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
J3KRW8 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
J3KRW8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
J3KRW8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
J3KRW8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
J3KRW8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
J3KRW8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
J3KRW8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
J3KRW8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
J3KRW8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
J3KRW8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
J3KRW8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
J3KRW8 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
J3KRW8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
J3KRW8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
J3KRW8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
J3KRW8 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
J3KRW8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
J3KRW8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
J3KRW8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
J3KRW8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
J3KRW8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
J3KRW8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
J3KRW8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
J3KRW8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
J3KRW8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
J3KRW8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
J3KRW8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
J3KRW8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
J3KRW8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
J3KRW8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
J3KRW8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
J3KRW8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
J3KRW8 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
J3KRW8 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
J3KRW8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
J3KRW8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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