Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
TNIKQ9UKE5 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TNIKQ9UKE5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms