Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM106CQ9BVX2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.8 ms