Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEFLP07196 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEFLP07196 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEFLP07196 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEFLP07196 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEFLP07196 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEFLP07196 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEFLP07196 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEFLP07196 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEFLP07196 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NEFLP07196 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEFLP07196 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEFLP07196 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NEFLP07196 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NEFLP07196 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NEFLP07196 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NEFLP07196 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NEFLP07196 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NEFLP07196 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NEFLP07196 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
NEFLP07196 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NEFLP07196 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEFLP07196 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEFLP07196 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEFLP07196 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEFLP07196 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEFLP07196 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEFLP07196 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEFLP07196 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEFLP07196 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEFLP07196 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEFLP07196 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEFLP07196 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEFLP07196 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEFLP07196 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEFLP07196 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEFLP07196 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEFLP07196 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEFLP07196 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEFLP07196 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEFLP07196 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEFLP07196 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEFLP07196 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEFLP07196 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEFLP07196 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEFLP07196 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEFLP07196 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEFLP07196 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEFLP07196 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEFLP07196 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEFLP07196 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEFLP07196 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEFLP07196 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEFLP07196 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NEFLP07196 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEFLP07196 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEFLP07196 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEFLP07196 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEFLP07196 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEFLP07196 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEFLP07196 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEFLP07196 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEFLP07196 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFLP07196 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFLP07196 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFLP07196 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFLP07196 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFLP07196 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFLP07196 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFLP07196 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFLP07196 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFLP07196 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFLP07196 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFLP07196 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFLP07196 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFLP07196 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFLP07196 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFLP07196 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFLP07196 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFLP07196 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEFLP07196 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEFLP07196 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEFLP07196 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEFLP07196 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEFLP07196 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEFLP07196 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEFLP07196 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEFLP07196 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEFLP07196 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEFLP07196 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEFLP07196 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEFLP07196 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEFLP07196 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEFLP07196 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEFLP07196 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEFLP07196 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEFLP07196 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEFLP07196 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEFLP07196 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEFLP07196 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms