Protein–RNA interactions for Protein: O96020

CCNE2, G1/S-specific cyclin-E2, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE2O96020 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 209.3 ms