Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPREB3Q9UKI3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms