Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms