Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEFLP07196 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEFLP07196 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NEFLP07196 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NEFLP07196 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NEFLP07196 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEFLP07196 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEFLP07196 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEFLP07196 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEFLP07196 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEFLP07196 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEFLP07196 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEFLP07196 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NEFLP07196 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEFLP07196 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEFLP07196 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEFLP07196 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEFLP07196 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEFLP07196 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NEFLP07196 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NEFLP07196 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEFLP07196 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEFLP07196 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEFLP07196 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NEFLP07196 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEFLP07196 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEFLP07196 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEFLP07196 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEFLP07196 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEFLP07196 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEFLP07196 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEFLP07196 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEFLP07196 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEFLP07196 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEFLP07196 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEFLP07196 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEFLP07196 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEFLP07196 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEFLP07196 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEFLP07196 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEFLP07196 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEFLP07196 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEFLP07196 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEFLP07196 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEFLP07196 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEFLP07196 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEFLP07196 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEFLP07196 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEFLP07196 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEFLP07196 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEFLP07196 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEFLP07196 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEFLP07196 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEFLP07196 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEFLP07196 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEFLP07196 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEFLP07196 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEFLP07196 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEFLP07196 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEFLP07196 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEFLP07196 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEFLP07196 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEFLP07196 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEFLP07196 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEFLP07196 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEFLP07196 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEFLP07196 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEFLP07196 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEFLP07196 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEFLP07196 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NEFLP07196 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEFLP07196 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEFLP07196 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEFLP07196 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEFLP07196 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEFLP07196 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEFLP07196 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEFLP07196 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEFLP07196 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEFLP07196 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEFLP07196 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEFLP07196 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEFLP07196 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEFLP07196 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NEFLP07196 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NEFLP07196 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NEFLP07196 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEFLP07196 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEFLP07196 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEFLP07196 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEFLP07196 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEFLP07196 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEFLP07196 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEFLP07196 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEFLP07196 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEFLP07196 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEFLP07196 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEFLP07196 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEFLP07196 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEFLP07196 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.9 ms