Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
BHMG1C9JSJ3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms