Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms