Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNE4Q8N205 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SYNE4Q8N205 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNE4Q8N205 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNE4Q8N205 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNE4Q8N205 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNE4Q8N205 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNE4Q8N205 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNE4Q8N205 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNE4Q8N205 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNE4Q8N205 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNE4Q8N205 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNE4Q8N205 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNE4Q8N205 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNE4Q8N205 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNE4Q8N205 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNE4Q8N205 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNE4Q8N205 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNE4Q8N205 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNE4Q8N205 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNE4Q8N205 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNE4Q8N205 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNE4Q8N205 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNE4Q8N205 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNE4Q8N205 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNE4Q8N205 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNE4Q8N205 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNE4Q8N205 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNE4Q8N205 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms