Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK2

SOHLH1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1Q5JUK2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SOHLH1Q5JUK2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SOHLH1Q5JUK2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms