Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
WDR53Q7Z5U6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms