Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARL2-SNX15V9GYD0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARL2-SNX15V9GYD0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARL2-SNX15V9GYD0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARL2-SNX15V9GYD0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARL2-SNX15V9GYD0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARL2-SNX15V9GYD0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARL2-SNX15V9GYD0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARL2-SNX15V9GYD0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARL2-SNX15V9GYD0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARL2-SNX15V9GYD0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15V9GYD0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15V9GYD0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15V9GYD0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15V9GYD0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15V9GYD0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15V9GYD0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15V9GYD0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15V9GYD0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15V9GYD0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15V9GYD0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15V9GYD0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15V9GYD0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15V9GYD0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15V9GYD0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15V9GYD0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15V9GYD0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15V9GYD0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15V9GYD0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15V9GYD0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15V9GYD0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15V9GYD0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15V9GYD0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15V9GYD0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15V9GYD0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15V9GYD0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15V9GYD0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15V9GYD0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15V9GYD0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15V9GYD0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15V9GYD0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15V9GYD0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15V9GYD0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15V9GYD0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15V9GYD0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15V9GYD0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15V9GYD0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15V9GYD0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15V9GYD0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15V9GYD0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15V9GYD0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15V9GYD0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15V9GYD0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15V9GYD0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15V9GYD0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15V9GYD0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15V9GYD0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15V9GYD0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15V9GYD0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15V9GYD0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15V9GYD0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15V9GYD0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15V9GYD0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15V9GYD0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15V9GYD0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15V9GYD0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15V9GYD0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15V9GYD0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15V9GYD0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15V9GYD0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15V9GYD0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15V9GYD0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15V9GYD0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15V9GYD0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15V9GYD0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15V9GYD0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15V9GYD0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15V9GYD0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARL2-SNX15V9GYD0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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