Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X0

SETBP1, SET-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETBP1Q9Y6X0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
SETBP1Q9Y6X0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
SETBP1Q9Y6X0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
SETBP1Q9Y6X0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
SETBP1Q9Y6X0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
SETBP1Q9Y6X0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
SETBP1Q9Y6X0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
SETBP1Q9Y6X0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SETBP1Q9Y6X0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
SETBP1Q9Y6X0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SETBP1Q9Y6X0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
SETBP1Q9Y6X0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
SETBP1Q9Y6X0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
SETBP1Q9Y6X0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
SETBP1Q9Y6X0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
SETBP1Q9Y6X0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
SETBP1Q9Y6X0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
SETBP1Q9Y6X0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
SETBP1Q9Y6X0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
SETBP1Q9Y6X0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
SETBP1Q9Y6X0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
SETBP1Q9Y6X0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
SETBP1Q9Y6X0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
SETBP1Q9Y6X0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
SETBP1Q9Y6X0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.58
SETBP1Q9Y6X0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
SETBP1Q9Y6X0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
SETBP1Q9Y6X0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
SETBP1Q9Y6X0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
SETBP1Q9Y6X0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
SETBP1Q9Y6X0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
SETBP1Q9Y6X0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
SETBP1Q9Y6X0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC37.42■■■■□ 3.58
SETBP1Q9Y6X0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC37.42■■■■□ 3.58
SETBP1Q9Y6X0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
SETBP1Q9Y6X0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
SETBP1Q9Y6X0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
SETBP1Q9Y6X0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
SETBP1Q9Y6X0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
SETBP1Q9Y6X0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
SETBP1Q9Y6X0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC37.39■■■■□ 3.58
SETBP1Q9Y6X0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
SETBP1Q9Y6X0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
SETBP1Q9Y6X0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
SETBP1Q9Y6X0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
SETBP1Q9Y6X0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
SETBP1Q9Y6X0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC37.37■■■■□ 3.57
SETBP1Q9Y6X0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
SETBP1Q9Y6X0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
SETBP1Q9Y6X0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
SETBP1Q9Y6X0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
SETBP1Q9Y6X0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
SETBP1Q9Y6X0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
SETBP1Q9Y6X0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
SETBP1Q9Y6X0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
SETBP1Q9Y6X0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
SETBP1Q9Y6X0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
SETBP1Q9Y6X0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
SETBP1Q9Y6X0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
SETBP1Q9Y6X0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
SETBP1Q9Y6X0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
SETBP1Q9Y6X0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
SETBP1Q9Y6X0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SETBP1Q9Y6X0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
SETBP1Q9Y6X0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
SETBP1Q9Y6X0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
SETBP1Q9Y6X0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
SETBP1Q9Y6X0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
SETBP1Q9Y6X0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
SETBP1Q9Y6X0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
SETBP1Q9Y6X0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
SETBP1Q9Y6X0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
SETBP1Q9Y6X0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
SETBP1Q9Y6X0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
SETBP1Q9Y6X0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
SETBP1Q9Y6X0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
SETBP1Q9Y6X0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
SETBP1Q9Y6X0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
SETBP1Q9Y6X0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
SETBP1Q9Y6X0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
SETBP1Q9Y6X0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
SETBP1Q9Y6X0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
SETBP1Q9Y6X0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
SETBP1Q9Y6X0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
SETBP1Q9Y6X0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
SETBP1Q9Y6X0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
SETBP1Q9Y6X0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
SETBP1Q9Y6X0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
SETBP1Q9Y6X0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
SETBP1Q9Y6X0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
SETBP1Q9Y6X0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
SETBP1Q9Y6X0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
SETBP1Q9Y6X0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
SETBP1Q9Y6X0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
SETBP1Q9Y6X0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
SETBP1Q9Y6X0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
SETBP1Q9Y6X0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
SETBP1Q9Y6X0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
SETBP1Q9Y6X0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
SETBP1Q9Y6X0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 242.3 ms